mixOmics для гуманитариев

Страница 4

plot(My_result. pca2)

Следующая команда:

My_result. pca2

Выведет собственные значения для первых трех главных компонент:

PC1       PC2       PC3

2. 8142478 1. 2477355 0. 7394421

Пропорциональное отношение объяснённой ими дисперсии:

PC1            PC2            PC3

0. 5433274      0. 2408917      0. 1427590

И совокупное значение оной по мере увеличения числа главных компонент:

PC1            PC2            PC3

0. 5433274      0. 7842191      0. 9269781

К сожалению, не существует строгих правил, руководствуясь которыми можно определить, сколько компонентов должно быть включено в PCA, – это зависит от данных и от уровня шума. Зачастую просто по приведённой выше диаграмме делают вывод о том, что увеличение количества главных компонент в модели не способствует резкому увеличению оставшейся доли объяснённой дисперсии.

С другой стороны, всегда можно посмотреть на переменные коэффициенты в каждом компоненте с векторами нагрузки. Весы нагрузки представлены по убыванию абсолютной величины снизу вверх. Абсолютное значение указывает на важность каждой переменной для определения каждого главной компоненты и представлено длиной каждого прямоугольника:

plotLoadings(My_result. pca)

Можно открыть справку командой? plotLoadings, чтобы ознакомиться с полным списком аргументов. Следующий пример покажет только две темы, оказавших наибольше влияние на разделение, с указанием их названий и увеличением шрифта на 10%:

plotLoadings(My_result. pca, ndisplay = 2,

Читать похожие на «mixOmics для гуманитариев» книги

Одна из важных составляющих любой видеоигры – ее персонажи. Взаимодействие с ними погружает нас в необычную атмосферу. Как способен на это набор из анимированных пикселей? В каждом вымышленном герое угадывается реальный человек: со своими эмоциями, тревогами, мимикой, да и сами проблемы видеогероев оказываются не такими уж и выдуманными. Именно об этом расскажет Денис Петришин – практикующий психолог, создатель канала PsyCase и автор материалов для роликов YouTube-канала TVG. На этот раз его

Билл Шутт – бывший профессор биологии в LIU-Post и научный сотрудник в Американском музее естествознания. Мир кровожадных животных, который открывает Билл Шутт, отправит вас в омерзительно-увлекательное путешествие, где вампировые летучие мыши, пиявки и прочие кровососущие станут главными героями почти детективных историй. Это одновременно самая пугающая и забавная книга о биологии и истории. Вряд ли вы где-нибудь еще прочтете такой подробный рассказ о жизни кровожадных животных и насекомых.

Краткий любовный роман. В реальном мире не всегда можно найти пятый угол, третий путь. Иногда хорошего выбора просто нет, но помечтать-то хоть можно? Впрочем, действительно ли у главного героя в результате попадания в чудесный мир всё хорошо или он просто выбирает меньшее зло?!

В этот многотомный биографический справочник вошли биографии лиц военно-политического состава Красной Армии, Военно-морского флота, войск НКВД и Пограничных войск, получивших воинское звание полковой комиссар с 1935 по 1942 гг. Биографии составлены на базе учетно-послужных карт, личных дел и списков командно-начальствующего состава РККА. Многие биографии публикуются впервые!

В этой книге на основе своего многолетнего опыта и сотрудничества приблизительно с сотней компаний автор рассказывает об использовании корпоративных мероприятий как инструмента развития корпоративной культуры компании. Она будет интересна в первую очередь руководителям фирм, их владельцам и HR-директорам, которые тратят большие деньги на организацию корпоративных праздников, но обычно проводят их для галочки и не получают от этого никакой отдачи. Кроме того, книга Дениса Бурховецкого пригодится

Отдаленное будущее, век космической экспансии. В глубоком космосе дрейфует колониальный звездолет, отправленный когда-то на поиски пригодных для жизни планет. Однако, из-за необъяснимой аварии, произошедшей сотню лет назад, корабль превратился в мрачный склеп, населенный чудовищами, а большинство выживших уже не верят, что за бортом есть другие миры. Юрий Гарин – разведчик, один из тех, кто не оставляет попыток пробиться в капитанскую рубку и вернуть людям контроль над системами управления. Мог

Перед вами пошаговое пособие для начинающего предпринимателя. В этой книге я постарался сконцентрировать весь мой опыт, все знания о начальных шагах в бизнесе. За много лет предпринимательской деятельности таких знаний накопилось немало.

Что будет, если ты очнешься на острове посреди океана совсем один? Выживешь ли ты там, попав в толпу фанатиков? Что будет, если в далеком будущем тебя насильно соединят с коллективным разумом? Кому и зачем это нужно? Что, если чей-то эксперимент провалился? Все ответы знает только он.

Как вести неограниченное количество проектов, не теряя в качестве, соблюдать сроки и приводить в восторг заказчиков? Денис Фурсенко – сертифицированный менеджер проектов PMP и PMI, среди клиентов которого Лукойл, Shell, Disney, McDonalds, Universal Parks и др., дает пошаговые инструкции по ведению проектов. Эти инструкции позволяют в разы увеличить скорость работы и довести до идеала выполнение каждой задачи! Эта книга поможет вам: • Выстраивать надежные отношения с заказчиками • Повысить

«Я – другой» – фантастический роман Дениса Деева, третья книга одноименного цикла, жанр ЛитРПГ, боевая фантастика. Вернулся на Землю после ста лет отсутствия по уважительной причине? И обнаружил, что цивилизация рухнула, а родной дом заполонили кровожадные твари? Это ерунда, не делай из этого драму! Монстры оказались не чудовищами, а обычными киборгами весело и задорно разделывающими друг друга на запчасти ради такой непонятной для тебя штуки как «прокачка»? Тоже мне трагедия, перестань